医学专业数据网站_医学数据平台
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Alliance of Genome Resources
Alliance of Genome Resources医学专业数据网站，由7个模式生物数据库(model organism databases，MODs)和GO数据库组成，其目标是向所有生物学、临床医学相关医学专业数据网站的研究人员提供一个综合医学专业数据网站的信息平台，促进使用多种模式生物来理解与人类健康和疾病的相关机制。
数据库链接医学专业数据网站：
https://www.alliancegenome.org/
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Human Protein Atlas
人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）是一个始于2003年的瑞典项目，旨在利用多种组学技术（包括基于抗体的成像技术、基于质谱的蛋白质组学、转录组学和系统生物学）绘制细胞、组织和器官中所有人类蛋白质的图谱，该数据库中的所有数据都是开放获取的。
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数据库链接：
https://www.proteinatlas.org/
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GeneCards
GeneCards是一个可搜索的综合数据库，提所有已注释的人类基因信息。该知识库以基因为中心自动整合来自大约150个数据库的数据，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、遗传学、临床学等信息。
数据库链接：
https://www.genecards.org/
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KEGG pathways
KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）是从基因和分子网络的角度系统分析基因功能的在线数据库，在1995年５月，在人类基因组计划框架下由日本京都大学化学研究所Minoru Kanehisa发起的。其中，KEGG PATHWAY是KEGG数据库最主要的部分，包含大多已知的代谢通路图（metabolic pathways）和调控通路图（regulatory pathways）。
数据库链接：
https://www.genome.jp/kegg/
实操教程：《想了解KEGG数据库？一起来“考古”》
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Wiki pathways
KEGG PATHWAY数据库是我们最熟悉的通路数据库，这里再分享一个功能类似的数据库，可以查找和下载目标物种的通路图。
数据库的链接：
https://www.wikipathways.org/index.php/WikiPathways
在Wiki pathways主页的Find Pathways区域，我们可以通过输入关键词（如通路名称、基因或蛋白名称、疾病名称等）查找感兴趣的通路图，比如这里输入Apoptosis（细胞凋亡）后点击Search按钮，查找得到的pathways的如下：
实操教程：《如何查找感兴趣的通路图？》
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NCBI Gene
当我们在进行基因功能研究的时候，首先要查看这个基因的基本信息。上文介绍过使用GeneCards数据库可查找与人相关的基因信息。但如果想查找更多物种的基因功能信息，我这里推荐大家使用Gene数据库。
Gene数据库的使用方法很简单，我们只需在搜索框中输入基因相关的关键词，比如基因名(symbol)，我这里输入BRCA1基因，然后点击Search按钮，得到的结果如下。
数据库链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/
实操教程：《如何查找感兴趣基因的信息？》
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HGNC
HGNC(HUGO Gene Nomenclature Committee) 负责提供人类基因唯一的名称，包括蛋白质编码基因、ncRNA基因和假基因，以便科研人员进行明确的科学交流。
数据库链接：
https://www.genenames.org/
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PDB
Protein Data Bank(PDB) 为存储蛋白质结构的数据库，提供蛋白的结构解析和功能注释。我们可以通过PDB查找蛋白的3D结构信息。
数据库链接：
https://www.rcsb.org/
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UniProt
UniProt（Universal Protein Resource）是一个综合性的蛋白质数据库，提供了全球范围内已知的蛋白质序列和功能信息。其中，UniProtKB（UniProt Knowledgebase）是最核心的组成部分，包含了经过注释和分类的蛋白质序列和功能信息。它提供了详细的蛋白质注释，包括序列特征、结构域、功能、亚细胞定位、酶活性等。
数据库链接：
https://www.uniprot.org/
实操教程：
《听说画好看的进化树需要知道这2个数据库》
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InterPro
InterPro是一个蛋白质家族的数据库，提供完整、准确的蛋白质家族和结构域的分类信息。主要通过对蛋白质进行分类以及预测结构域和重要位点，来提供蛋白质的功能分析，这对蛋白的功能研究非常有帮助。
数据库链接：
https://www.ebi.ac.uk/interpro/
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BioGRID
BioGRID是一个基因相互作用的数据库，数据主要来源于文献挖掘，包括常规实验结果和高通量数据验证结果，使用它可以轻松完成基因互作关系的预测。
数据库链接：
https://thebiogrid.org/
实操教程：《分享一个基因蛋白互作数据库》
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dbSNP
dbSNP（Single Nucleotide Polymorphism Database）存储了人类和其他物种的单核苷酸多态性数据，对研究遗传变异很有帮助。
数据库链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/
好啦，本次的实用数据库分享就先到这里啦医学专业数据网站！
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